Обновил Eclipse до версии 4.5 (Mars). Стал очень медленно работать скроллинг в редакторе, что очень раздражает. После недолгого гугления оказалось, что все дело в плагине с темами https://github.com/jeeeyul/eclipse-themes. Для того, чтобы все пришло в норму, установите переменную окружения SWT_GTK3 в 0. Я создал отдельный файл для запуска Eclipse такого содержания: